由于某些缘故,芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。
自从七原秋也与中川典子从新世纪教育法(简称BR)中逃出,两年转眼就过去了。人类社会进入了恐怖主义时代!首都在反BR国家的恐怖分子的袭击下,化为一片废墟。政府当局认定凶犯为七原秋也,开始了对其国际通缉。
FAIZ将冲破黑暗,为这个世界带来光明。一个在不久的将来发生在某个国家的故事。在那里,世界上大部分地区已经被人类的进化形式——“再生使徒”所支配。在再生使徒之城,人类的存在是不允许被人类隐藏和生活的。其中,有一个叫远田真嗣的年轻女孩。