音乐大学学生,同时兼职原稿运送员的桥本巧(竹内力 饰)是个热爱机车的追风青年。偶然机会,他结识了前辈泽田秀政(三浦友和 饰)的妹妹冬美(渡边典子 饰),两人共度了浪漫的夜晚。
故事发生在2029年,当时受到病毒袭击的日本陷入混乱,被一个名为“GHQ”的暴力组织接管。政府逐渐成为傀儡。在这样一个动荡的环境中,小仓曼二(由加吉由纪配音)只是一个普通的高中生,过着平凡的生活,直到这个女孩楪 ki(由茂野爱一配音)出现在他面前。齐的真实身份是“殡葬协会”的成员,该协会不断从事危险和残酷的战争,旨在从GHQ手中夺回日本的自治权。在该组织领导人津上信也(中村裕一配音)的指导下,他成为了该组织的一员,并结识了Ayase Miyako(川崎配音)和Thrush(武田彩奈配音)等同事。随着战斗的升级,各种迹象表明,姬似乎拥有神秘的力量,而在许多敌人背后隐藏着什么强大的存在,大家都不知道
故事发生在日本江户时代,当时一名神秘男子出现在武士桂(石田明配音)面前。他手里拿着魔剑“红樱”,要求对其进行测试。当晚之后,桂的下落不明。桂的宠物伊丽莎白(高松伸树配音)从万石屋找到了信高(Naomiya Rihui配音)和信矢加(Sakaguchi Daisuke配音),并委托他们寻找主人的下落。与此同时,银石(杉田智和饰)也被委托寻找调皮捣蛋的红樱的下落。三人的线索聚集在一艘飞艇上,由于远离警方的管辖范围,飞艇内的邪恶势力被完全隐藏起来。在那里,银石遇到了他的前战友、现任对手高崎信三(由齐安武史配音),他正带领他的幽灵军队试图摧毁江户。一边是令人发指的恐怖分子,另一边是残忍嗜血的妖刀红鹰。身受重伤的银石能否安全逃生,拯救江户?这部剧场版翻拍了《银魂》动画中的《红樱物语》,没有出现在原作中的真选组也将在故事中展示他们的技巧。