随后，发生了多起神秘女子在警方不知所措的情况下采取行动解决事件的案件。事实证明，这个神秘的女人是一个正义的战士，她在《可爱的蜂蜜》中声称自己有神奇的能力。她将面对同样拥有魔法能力的犯罪集团“凡萨圣衣”的成员，四大天王，以及他们的头目希斯塔吉尔。为了防止日本受到“凡萨圣衣”的破坏，翠特蜜与青儿早美、女警秋雅子等《每日早报》记者联合作战。而可爱蜜的真实背景也在与“凡萨圣衣”的战斗中逐渐浮出水面。
“新生篇章”的内容延续自第24集的内容：在第17使徒被消灭后，SEELE向NERV发出命令，要求EVA第一架飞机负责执行“人类完成计划”。然而，秀吉并不同意SEELE的做法，并拒绝执行。SEELE认定这是一种反叛行为，并决定彻底消灭NERV。黎明时分，NERV总部突然遭到战略自卫队的袭击，他们对NERV人员进行了残酷的屠杀。为了保护司机，葛成美利下令将精神崩溃的阿基拉送上第二架飞机，并将其安置在湖底深处。他亲自去营救日久真嗣。但在这一点上，Ikashi Shinji已经处于精神崩溃的边缘。
