主角祥子是一名在流星学院学习的中学生。自从五年前出国留学以来,她的妹妹祥子就一直下落不明,她和祥子很亲近。一天,一个不明身份的人突然袭击了祥子。袭击她的是邪恶之神厄里斯的部下,厄里斯过去曾被女神雅典娜封印。
管理员千绘子(齐藤贵美子 饰)喜欢做人偶;玛雅雅(冈村明美 饰)则是个三国爱好者;邦巴则 热衷铁道;吉吉(能登麻美子 饰)则是中老年男性控……天水馆成了她们的小家和小天堂。而另一边鯉淵蔵之介(斋藤弥月 饰)则出身名门,但不想继承家业的他,以女装打扮,梦想成为服装设计师。宅女和伪娘的故事就此拉开了序幕…… 本作改编自东村明子的同名漫画。该漫画曾获得2010年第34届讲谈社漫画赏少女部门赏。
电影版《新世纪福音战士》的第一部。它分为两部分:“死亡”和“重生”。“死亡篇”是根据动画电视原版第1集至第24集的内容改编的,其中一个总结章节经过了重新编辑。