无法在这个世界使用炼金术的爱德华，与长相酷似弟弟的青年爱尔凡斯一起研究火箭的科技，希望借助火箭回到原来的世界。另一边的炼金术世界，弟弟阿尔冯斯修行炼金术，打扮宛若曾经的爱德华，与国家炼金术士们一起寻找找回哥哥的方法。 而暗地中，慕尼黑的一个神秘组织开始了寻找理想国“香巴拉”的仪式，连接炼金术世界与现实世界的“门”被打开了。 兄弟二人的命运与两个世界的危机交织在一起，爱力克兄弟要面对前所未有的挑战。
然而，看似拥有一切美好的天马，却逐渐感到良心上的不安。他亲眼目睹了医院为了拯救重要人物而忽视了危重的普通人。死者家属的指责和眼泪让天马遭受了巨大的痛苦。当这种困境再次来临时，天马果断选择营救一名头部中弹的男孩。他牺牲了自己的事业和爱情来换取一个可怕怪物的复活。在接下来的几年里，天马和怪物约翰斗智斗勇，一段尘封已久的历史慢慢被揭开。。。这部电影是根据日本漫画家浦泽直树的同名原作改编的。
