故事发生在《哥斯拉2：怪物之王》中，哥斯拉与泰坦怪物之间令人震惊的战斗使旧金山变得平坦，并证实了怪物的存在。凯特再一次被一个令人震惊的秘密吓坏了。面对巨大的威胁，她开始了一场全球冒险，以了解她的家人和神秘组织“皇帝”的真相。
CG制作公司“studio delta”的工作人员大森道江（上田龙雄饰演）是一名性依赖女性，有五个朋友。她认为“性是一种自由的爱好”，但相反，她爱上了在一家商业公司工作并有女朋友的阿俊（矢野英久饰演）。她对单恋感到无助、悲伤和空虚。
藤原拓海由于不败的战绩，必然会受到新的挑战。 《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。
