为了对抗突然出现的人类敌人“尼禄”,世界各国组成了一支联合军队。但只有拥有特殊魔法的女孩才能对抗她们。由联合部队领导的柏林夺回行动终于开始了,第501联合作战航空团“对女巫的袭击”再次组建了一支军队。
即将大学毕业的摇滚青年盐野阳平(本木雅弘饰),作为寺庙的继承人,他被迫进入寺庙修行一年。他放不下的还有女朋友真朱(铃木保奈美饰),她是一名时尚的女孩,她也不希望阳平去当和尚。 僧侣生活随即拉开,弟弟还有同是继承人身份的胖子几人也加入修行行列。
故事发生在明星学园的十年黑组之中,那是一个由十二名顶尖暗杀者所组成的神秘班级,这一次,致使她们齐聚一堂的,是一位名叫一之濑晴(金元寿子 配音)的平凡女生,她是这十二个冷酷杀手共同的目标。