故事发生在一个人族、魔族和神族和平共处的世界之中。土见禀(杉田智和 配音)是一个非常平凡的男孩,自幼失去了父母的他和青梅竹马的好友枫(后藤邑子 配音)生活在同一屋檐下,虽然禀只将枫当成是妹妹一样疼爱,课时枫对于禀的感情早已经超越的了友情。続いて派遣された2号機は、ガメラの過去の戦歴を調べ、ガメラが子供の味方であることを知る。ガメラシリーズ第4作。