故事告诉的是Eido大学社会学副教授Yingsheng Huomura(Saito Gong),他受警方委托协助调查一起谋杀案。然而,他内心隐藏着黑暗的一面,并承认从事极端犯罪,甚至有杀人的想法。続いて派遣された2号機は、ガメラの過去の戦歴を調べ、ガメラが子供の味方であることを知る。ガメラシリーズ第4作。