现实世界中喜爱电玩的主人公铃木悟(真名)在等待系统强制登出时,与“安兹·乌尔·恭”公会的成员意外穿越到了异世界,并且自己还变成了拥有骷髅外表的最强魔法师——“飞鼠”。就这样,真正的奇幻传说正式拉开帷幕.
命运中的相遇出现了,小圆在路边救了一只浑身是伤的奇怪动物。出乎意料的是,这种动物会说人类的语言。它告诉小圆它的名字叫Chubi(由加藤英美配音),并提出了一个特殊的要求,希望小圆能与它签约,成为一个神奇的女孩。魔法女孩在这个世界上是一种特殊的存在,肩负着与女巫斗争的使命。作为奖励,丘比可以实现他们的任何愿望。在战斗中,小圆发现魔法少女的职业并不像故事中描述的那样美丽,而且随时都有牺牲的可能。随着战斗的升级,关于她自己的残酷真相逐渐浮出水面。