高中生主角高野春弘迷恋法国著名诗人波德莱尔的代表作《邪恶之花》,他的同学中村佐助目睹了偷走班花体操服的场景,然后被她的各种荒谬要求取笑。有一天,一个被称为“巨人”的异常巨大的怪物入侵了人类世界,其巨大的破坏力使人类在很短的时间内失去了大片土地。为了保护他们生存的最后家园,人类建造了高墙,生活在极其有限的空间里,就像被囚禁在无尽的恐惧中一样,长达一百年。普通的高二学生吉山正人,由于存在感薄弱,被戏称为“路人”,但他实际上是一个强大的天生超能力。