在遥远的十二号行星阿莫伊上,存在着一个扭曲的社会。这个社会由巨型电脑朱庇特所掌控。为了净化基因,人类被放逐了,一般的生育方式被彻底抛弃,朱庇特通过直接操控基因的方式,制造出了一大群更加完美的生物体,他们美丽,强壮,聪明,但冷酷无情、野心勃勃。
可是,大学生选拔队的实力比一般高中生战车道队强很多倍之外,她们所使用的战车比高中生们所用的更先进,此外,队长还是西住流旗鼓相当的战车道世家—岛田流出身……不过,美穗等人得到各个学园舰的战车道部出手支援,一起为守护大洗学园而并肩作战。
因突变而产生操作火焰的变种人“燃烧者”,让半个世界被大火烧成焦土,陷入前所未见的惨状。在那之后的30年,当中一群激进份子“疯狂燃烧者”再次对世界发动攻击。