森津和子(由Kazuki Kazuki配音)在一所高中担任代课老师。由于一次悲惨的经历,Kazuko紧紧地闭上了自己的心,不再接受任何人的照顾。陆生爱上了这样一个孩子,默默地守候在她的身边。叶忠清(由宫本裕也配音)是一个早熟的女孩,她很早就离开了家,进入了社会。一次偶然的机会,她爱上了陆生,并意识到了他对Koko的感情。
虽然阿丽莎已经异形化,并且犯下了滔天的罪行,但欧菲依然相信自己能够找到让姐姐恢复原状的方法。 在旅途中,欧菲邂逅了开朗又活泼的大小姐克丽奥(大久保瑠美 配音),和非常崇拜欧菲,拜他为师的青年马吉克(小林裕介 配音),三人结伴而行,与此同时,欧菲的师父查尔德曼也集结了曾经的一群战友,决定正式启动讨伐阿丽莎的计划。
为此,火星政府悬赏3亿元人民币捉拿恐怖分子。目睹了这一事件的费伊独自行动,试图垄断赏金。Ed使用黑客技术寻找线索,并与Bebop上的每个人合作。四人一狗的组合再次部署,但他们不知道这3亿元的成本是为了对抗前所未有的强大罪犯。