1年9班消失不见，朝比奈学姐视其形同路人，甚至早已死去的朝仓也代替凉宫春日坐在了阿虚的后面，而春日则如同人间蒸发一般无人知晓。当他冲向SOS团的教室时，只看到了孤零零坐在角落里看书的长门有希，一向淡定自若、冷如冰霜的长门大神也变成了怯懦害羞的乖乖女。从前一日长门留下的蛛丝马迹中，阿虚判断出这个世界似乎被某人重组了一番。 此时的阿虚，握有连接两个绝然不同世界的钥匙，他面临着重大的选择……
埃鲁鲁告诉这名男子，她是一个“亚人类”，她和她的人类同胞住在远离城市的深山里，通过种植和务农过着简单的生活。族长给这个人起了哈科罗的名字（也由肖善利配音），从此，哈科罗在这个宁静的山村过着平静的生活。村里住着一群善良快乐的人。Huckoro用他的智慧帮助村民耕种，迅速提高了粮食产量，也在村民中获得了很高的声望。当村民们和家人一起庆祝丰收年时，野心勃勃的领主将贪婪的目光转向了他们。封建领主贪污粮食，增加税收，使本已贫困的村民不堪忍受。最后，村民们忍无可忍地爆发了，领导起义的不是其他人，而是哈科罗本人。他们能推翻腐败的统治吗？哈克的真实身份是谁？所有这些都在战争的进程中得到了回应。
因为在风祭流传着未确认生物的情报，以及超自然的现象之类的似真非真的传闻。瑚太朗向超自然研究会的部长，千里朱音的求助，于是展开了涉及到瑚太朗认识的学生们的调查。对于瑚太朗来说，原本只是抱着一点冒险心态而已。
