它告诉了童年恋人钱霞和春泰面临游戏部门取消的故事。为了去游戏世界的最高殿堂“普门殿”，他们两人一边努力练习，一边寻找新成员。然而，在他们两人之前，一系列的谜题逐渐浮出水面。。。本作中另类的“推理+玩系”设定值得期待。
安妮（叶仙儿 饰）和男友约翰即将携手步入婚礼的殿堂，就在这个节骨眼上，约翰遭遇了非常可怕的车祸，不幸丧生，不仅如此，安妮腹中约翰的孩子也随之而去，失去一切的安妮陷入了绝望之中。
可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。 而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案，都在「Link Vrains」中
