谁知当一切都按部就班进行之时，意外突然发生。与此同时，距离大使馆不远的一座摩天大楼内，日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀，素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹（浅野麻由美 饰）也在爆炸中丧生。经过缜密追查，素子等人发现一种能够篡改记忆的病毒正在网络蔓延，而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前，阴谋悄然复出水面…… 本片根据士郎正宗的同名原作改编，系《攻壳机动队》诞生25周年纪念作品。
从《假面骑士Kuuga》起平成骑士系列的世界融合了！巡游于九个骑士世界，破坏与创造的故事即将拉开序幕！ 照相馆之女・夏海，梦见了众多假面骑士与谜之敌的交战。
这个故事讲述了告诉（村田配音）的故事，他住在冲绳岛附近。他遇到了一个孤独的高中生，他失去了父母，石羊知画（松冈配音），两个十几岁的孩子成为了朋友。石羊为了迅速长大成人，决定离开小岛，两人逐渐失去联系。
