在一个阳光明媚的日子里,柯南(高山南配音)、小兰(山崎和加奈配音)以及少年侦探队的朋友们在毛利小五郎(也由小山立配音)的陪同下前往大阪,参加当地举行的“高中生高岳杯”百人一和声比赛。21世纪,地球恢复了往日的平静,但此时,一颗陨石从宇宙中坠落,陨石上有一个人造的时间胶囊。地球和平联盟TPC的GUTS团队通过时间胶囊了解到,地球上将发生重大灾难。